Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TAF3Q5VWG9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TAF3Q5VWG9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms