Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVS0

C1orf140, Putative uncharacterized protein C1orf140, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf140Q5VVS0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C1orf140Q5VVS0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms