Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
OBSCNQ5VST9 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms