Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSR9

SPANXN1, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N1, humanhuman

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN1Q5VSR9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
SPANXN1Q5VSR9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPANXN1Q5VSR9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms