Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HDGFL1Q5TGJ6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HDGFL1Q5TGJ6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms