Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NUP188Q5SRE5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NUP188Q5SRE5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms