Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM74A1Q5RGS3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM74A1Q5RGS3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM74A1Q5RGS3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM74A1Q5RGS3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM74A1Q5RGS3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM74A1Q5RGS3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM74A1Q5RGS3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM74A1Q5RGS3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FAM74A1Q5RGS3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAM74A1Q5RGS3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms