Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTSL3PQ5NE16 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms