Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC27A3Q5K4L6 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC27A3Q5K4L6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC27A3Q5K4L6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms