Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDK2Q58EX2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDK2Q58EX2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDK2Q58EX2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDK2Q58EX2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDK2Q58EX2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDK2Q58EX2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDK2Q58EX2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDK2Q58EX2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDK2Q58EX2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDK2Q58EX2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDK2Q58EX2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDK2Q58EX2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDK2Q58EX2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDK2Q58EX2 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDK2Q58EX2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDK2Q58EX2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDK2Q58EX2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDK2Q58EX2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDK2Q58EX2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDK2Q58EX2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDK2Q58EX2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDK2Q58EX2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDK2Q58EX2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDK2Q58EX2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDK2Q58EX2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDK2Q58EX2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SDK2Q58EX2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SDK2Q58EX2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SDK2Q58EX2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SDK2Q58EX2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SDK2Q58EX2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SDK2Q58EX2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SDK2Q58EX2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SDK2Q58EX2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SDK2Q58EX2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms