Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TDRD12Q587J7 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TDRD12Q587J7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms