Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SFT2D3Q587I9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms