Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HSD17B12Q53GQ0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSD17B12Q53GQ0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms