Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
C4orf46Q504U0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
C4orf46Q504U0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms