Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
KRTAP21-3Q3LHN1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
KRTAP21-3Q3LHN1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms