Protein–RNA interactions for Protein: Q3LFD5

USP41, Putative ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 41, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41Q3LFD5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP41Q3LFD5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP41Q3LFD5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms