Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ISXQ2M1V0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms