Protein–RNA interactions for Protein: Q1ZZU3

SWI5, DNA repair protein SWI5 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWI5Q1ZZU3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SWI5Q1ZZU3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SWI5Q1ZZU3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
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