Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
ATP2B3Q16720 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATP2B3Q16720 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms