Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC18A3Q16572 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18A3Q16572 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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