Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SSX2Q16385 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SSX2Q16385 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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