Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SSX1Q16384 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SSX1Q16384 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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