Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN9AQ15858 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN9AQ15858 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN9AQ15858 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN9AQ15858 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN9AQ15858 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCN9AQ15858 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SCN9AQ15858 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
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