Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC85BQ15834 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC85BQ15834 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
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