Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HMGN3Q15651 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HMGN3Q15651 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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