Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TAF1AQ15573 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TAF1AQ15573 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms