Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SF3A1Q15459 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SF3A1Q15459 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SF3A1Q15459 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SF3A1Q15459 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SF3A1Q15459 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SF3A1Q15459 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SF3A1Q15459 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SF3A1Q15459 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SF3A1Q15459 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SF3A1Q15459 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SF3A1Q15459 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SF3A1Q15459 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SF3A1Q15459 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SF3A1Q15459 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SF3A1Q15459 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SF3A1Q15459 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SF3A1Q15459 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SF3A1Q15459 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SF3A1Q15459 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SF3A1Q15459 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SF3A1Q15459 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SF3A1Q15459 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SF3A1Q15459 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SF3A1Q15459 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SF3A1Q15459 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SF3A1Q15459 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SF3A1Q15459 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SF3A1Q15459 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SF3A1Q15459 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
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