Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RABEP1Q15276 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RABEP1Q15276 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
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