Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NKX1-1Q15270 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms