Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PDGFRLQ15198 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PDGFRLQ15198 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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