Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDK1Q15118 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PDK1Q15118 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDK1Q15118 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PDK1Q15118 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDK1Q15118 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PDK1Q15118 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PDK1Q15118 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDK1Q15118 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDK1Q15118 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDK1Q15118 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PDK1Q15118 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDK1Q15118 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDK1Q15118 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PDK1Q15118 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PDK1Q15118 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PDK1Q15118 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PDK1Q15118 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDK1Q15118 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDK1Q15118 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDK1Q15118 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDK1Q15118 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDK1Q15118 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDK1Q15118 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDK1Q15118 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDK1Q15118 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDK1Q15118 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDK1Q15118 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDK1Q15118 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDK1Q15118 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDK1Q15118 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDK1Q15118 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDK1Q15118 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
PDK1Q15118 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PDK1Q15118 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PDK1Q15118 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDK1Q15118 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDK1Q15118 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDK1Q15118 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PDK1Q15118 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PDK1Q15118 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PDK1Q15118 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDK1Q15118 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDK1Q15118 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDK1Q15118 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDK1Q15118 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDK1Q15118 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDK1Q15118 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDK1Q15118 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDK1Q15118 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PDK1Q15118 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDK1Q15118 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDK1Q15118 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDK1Q15118 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PDK1Q15118 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDK1Q15118 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PDK1Q15118 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PDK1Q15118 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDK1Q15118 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDK1Q15118 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDK1Q15118 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDK1Q15118 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDK1Q15118 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDK1Q15118 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PDK1Q15118 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDK1Q15118 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PDK1Q15118 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PDK1Q15118 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PDK1Q15118 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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