Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
BRD3Q15059 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
BRD3Q15059 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms