Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
R3HDM1Q15032 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
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