Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMD6Q15008 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD6Q15008 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
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