Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SMCO1Q147U7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
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