Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RRP1BQ14684 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RRP1BQ14684 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms