Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms