Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BECN1Q14457 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BECN1Q14457 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
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