Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
GTF2H2Q13888 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2H2Q13888 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2H2Q13888 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2H2Q13888 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2H2Q13888 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2H2Q13888 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2H2Q13888 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2H2Q13888 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2H2Q13888 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2H2Q13888 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2H2Q13888 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2H2Q13888 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2H2Q13888 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2H2Q13888 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTF2H2Q13888 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms