Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
KLF9Q13886 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KLF9Q13886 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms