Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SPTAN1Q13813 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SPTAN1Q13813 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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