Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CUL4AQ13619 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
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