Protein–RNA interactions for Protein: Q13506

NAB1, NGFI-A-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAB1Q13506 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NAB1Q13506 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NAB1Q13506 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NAB1Q13506 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NAB1Q13506 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NAB1Q13506 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAB1Q13506 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAB1Q13506 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAB1Q13506 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAB1Q13506 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAB1Q13506 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAB1Q13506 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAB1Q13506 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAB1Q13506 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAB1Q13506 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NAB1Q13506 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAB1Q13506 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NAB1Q13506 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAB1Q13506 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAB1Q13506 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NAB1Q13506 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
NAB1Q13506 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms