Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MSLNQ13421 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MSLNQ13421 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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