Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRSQ13332 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
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