Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGDRQ13258 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGDRQ13258 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGDRQ13258 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGDRQ13258 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGDRQ13258 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGDRQ13258 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGDRQ13258 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGDRQ13258 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PTGDRQ13258 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTGDRQ13258 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms