Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RPA4Q13156 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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