Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TRAF3Q13114 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAF3Q13114 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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