Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
PRDM2Q13029 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC35.8■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PRDM2Q13029 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
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