Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BNIP1Q12981 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms